Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms