Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SELENBP1Q13228 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SELENBP1Q13228 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms