Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
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