Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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