Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM2Q13029 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
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