Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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FOXC1Q12948 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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