Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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