Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms