Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms