Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC8Q09428 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms