Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms