Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms