Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms