Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms