Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYBPC1Q00872 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms