Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITPNAQ00169 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms