Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP1P78357 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms