Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB1P62873 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms