Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms