Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms