Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms