Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms