Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAMP50895 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAMP50895 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAMP50895 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms