Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERFP50548 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERFP50548 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ERFP50548 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERFP50548 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ERFP50548 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms