Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms