Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP8P40818 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP8P40818 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP8P40818 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP8P40818 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms