Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LINC01132-202ENST00000641214 1085 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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