Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC9P31274 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC9P31274 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms