Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms