Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms