Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX2P28328 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PEX2P28328 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms