Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms