Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HRCP23327 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HRCP23327 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HRCP23327 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HRCP23327 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HRCP23327 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HRCP23327 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HRCP23327 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HRCP23327 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms