Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT1P21579 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms