Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms