Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN1P17029 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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