Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPB42P16452 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPB42P16452 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPB42P16452 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms