Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME1P15531 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME1P15531 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME1P15531 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME1P15531 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME1P15531 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms