Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms