Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR35P0CG20 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms