Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms