Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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MSMBP08118 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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