Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms