Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRATO95237 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRATO95237 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRATO95237 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRATO95237 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRATO95237 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRATO95237 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRATO95237 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRATO95237 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRATO95237 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms