Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms