Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms