Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms