Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms