Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms