Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms